El 13 de maig de 2014, just cent anys després de la declaració pontifícia de la Verge de Meritxell com a patrona de les Valls d'Andorra, el Santuari va ser declarat basílica menor. A la imatge, les autoritats andorranes reben les autoritats eclesiàstiques el dia del nomenament.
Actualment, Meritxell s’erigeix com un dels exponents més representatius de l’arquitectura d’Andorra del final del segle XX. Els seus volums arquitectònics formen part indissociable del nostre paisatge cultural. A l’interior del temple, a més de la imatge de la Verge –una reproducció impresa en 3D– que presideix la nau, hi ha set escultures, obra de Sergi Mas, corresponents als patrons de les esglésies parroquials, que ratifiquen que Meritxell és el santuari nacional.
Amb l’aprovació de la Constitució, l’any 1993, es va abolir la sessió que el Consell General duia a terme anualment al Santuari el dia de Meritxell, el 8 de setembre, festa de les marededeus trobades. Aquest fet va significar una separació del poder polític i secular i la festivitat va recuperar el seu sentit social i religiós.
El Santuari, a més, va ser declarat basílica menor el juliol del 2014 pel papa Francesc. A través d'un rescripte de la Congregació per al culte diví va concedir a l'església del Santuari de la Mare de Déu de Meritxell el títol i la dignitat de basílica menor. La concessió va respondre a la petició efectuada uns mesos abans pel bisbat d'Urgell amb el vistiplau de les autoritats andorranes amb motiu del centenari de la declaració pontifícia de la Mare de Déu de Meritxell com a patrona principal de les Valls d'Andorra en temps de sant Pius X. La celebració solemne de la concessió del títol va tenir lloc durant la festivitat de Nostra Senyora de Meritxell següent, el 8 de setembre del 2014.
El títol de basílica menor és una distinció concedida pel Papa a les esglésies més importants que, en atenció a la seva història i cultura, vida litúrgica i pastoral, són particularment significatives. La diòcesi d’Urgell compta amb tres basíliques menors: el Santuari de Meritxell, la catedral de Santa Maria de la Seu d'Urgell i la basílica de la Mare de Déu de Valldeflors de Tremp. La concessió del títol va obligar a canviar l'ambó per un de fix de pedra.
El mateix any de la distinció com a basílica menor, el Santuari de Meritxell es va incorporar a la Ruta Mariana.
L'Arxiu Nacional d'Andorra conserva el fons Josep Moles, un petit fons de 135 imatges de la construcció del nou Santuari de Meritxell que es pot consultar en línia. Moles, gran aficionat a la fotografia, va fer tot el seguiment de la construcció, alhora que la seva empresa era la responsable de fer-ne la instal·lació elèctrica. Les fotografies abracen el període de construcció des de l'any 1974 fins a la inauguració, el 1976.
El Santuari nou també acull l’exposició permanent Bíblies del món, inaugurada el setembre del 2016. La mostra recull una col·lecció en creixement permanent, formada per més de 1.600 exemplars entre bíblies i nous testaments, en més de 1.400 idiomes, dialectes i suports diferents.
Dins del claustre dels miralls es pot veure l'exposició El nostre romànic... en petit format, una mostra de maquetes de les esglésies romàniques d'Andorra.
Es tracta d'una col·lecció de deu maquetes (l'antic santuari de Meritxell, Sant Serni de Nagol, Sant Climent de Pal, Santa Coloma, Sant Miquel d'Engolasters, Sant Romà de les Bons, Sant Joan de Caselles, Sant Martí de la Cortinada, Sant Cristòfol d'Anyós i Sant Esteve del Mas d'Alins) a escala 1:50 realitzades per l'artesà Carlos Pérez Castelló i propietat de Crèdit Andorrà que va ser inaugurada el dia de Meritxell de 2009.